朱汉章曾发表科研论文二十多篇。撰写科研论文，进行深入细致的机理探讨，参与科学共同体的学术交流与研讨，接受严格的甚至苛刻的科学检验和技术鉴定则任何一项科研创新、发明发现的必经之路。朱汉章于1976年发明小针刀疗法，1984年通过江苏省卫生厅组织的技术鉴定。1986年在全国骨伤科外固定学会 第二届学术交流会上宣读论文，被评为全国优秀论文并获得华佗金像奖。此奖的获得，极大地扩大了小针刀疗法的影响，使之获得了科学共同体的加冕，使之受到当代主流价值观，即科学的理性的价值标准的认同。这种加冕以及由专家进行的成果鉴定是一个通行证，使小针刀疗法从民间疗法上升为科学技术，成为正统的、合法 的、常规的医疗技术，成为生产力，可以更有效地为更广大的患者解除疾苦。
　　朱汉章近年发表的科研论文：
（1） 持续压应力诱导体外培养的软骨细胞产生细胞因子. 朱汉章张平 刑东明 郭浩去. 北京：首届国际针刀医学学术交流会. 1999年
（2） 针刀治疗骨性关节炎的机理临床实践研究（一）.朱汉章崔秀芳 柳百智 庞继光. 北京：首届国际针刀医学学术交流会. 1999年
（3） 针刀治疗骨性关节炎的机理临床实践研究（二）.朱汉章崔秀芳 柳百智 庞继光. 北京：首届国际针刀医学学术交流会. 1999年
（4） 慢性软组织损伤疾病病因病理学方面的新理论 - 动态平衡失调.朱汉章.针刀医学论文精选及第四届全国针刀医学学术交流大会
（5） 略论小针刀治疗内科杂病的原理.朱汉章.中国中医药学会第三届全国小针刀疗法学术交流大会论文集
（6） 针刀医学和针刀的定义.朱汉章.第五届全国针刀医学学术交流大会


医学著作：

（1） 小针刀疗法.北京：中国中医药出版社,1992年（30万字，至2001年重印11次，销售11万册）
（2） 膝关节外科学.北京：中国医药科技出版社,1990年（40万字）
（3） 传统手法180种.华侨医药科技出版社，1992年（20万字）
（4） Small Needle Scalpel Therapy. Beijing: Chinese Publishing House of 　Traditional Chinese Medicine and Pharmacology, 1991（25万字）
（5） 针刀医学系列教学片（15集，15小时）北京：中国协和医科大学音像出版社,1997年
（6） 针刀医学临床问题解析.北京：人民卫生出版社，1999年（50万字）
（7） 针刀医学原理.北京：人民卫生出版社，2002年（210万字）
（8） 朱汉章任总主编的24部针刀医学系列丛书正在编写之中。它们是：《中西医与针刀医学》、《微观解剖学》、《立体解剖学》、《动态解剖学》、《体表定位学》、《针刀闭合性手术入路图谱》、《针刀医学影像学》、《针刀医学手法学》、《针刀医学诊断学》、《针刀医学治疗学》、《针刀医学配套的治疗器械系列产 品》、《针刀医学护理学》、《针刀医学内科学》、《针刀医学外科学》、《针刀医学软组织损伤学》、《针刀医学治疗关节内骨折》、《针刀医学矫形外科学》、《针刀医学儿科学》、《针刀医学妇科学》、《针刀医学五官科学》、《针刀医学皮肤学》、《针刀医学风湿病学》、《针刀医学骨坏死》、《针刀医学闭合性手术 学》

　
获奖证书、聘书、专利证书：

（1） 全国骨伤科固定学会常务理事证书（1984）
（2） 淮阴市人民政府科技进步二等奖证书（1985）
（3） 中国传统医学手法研究会副理事长聘书（1985）
（4） 全国华佗金像奖证书、金像奖(1986)
（5） 全国骨伤科外固定学会第二届学术交流会优秀论文证书（1986）
（6） 全国颈肩腰腿痛第六次学术大会论文宣读证书（1986）
（7） 全国第二届生物固体力学学术讨论会论文宣读证书（1986）
（8） 江西庐山竹泉山庄康复疗养院名誉院长证聘书（1987）
（9） 中国专利局授予新型手术针刀专利证书(1987)
（10） 铁道部工程指挥部总医院顾问聘书（1988）
（11） 中国骨伤杂志社编辑委员会副主任委员聘书（1988）
（12） 图文：小针刀疗法获第37届尤里卡世界发明博览会金奖证书（1988年小针刀疗法获第三十七届尤里卡世界科技博览会金牌奖，朱氏本人获“军官“勋章，为我国医学界获此奖的第一人）
（13） 朱汉章获第37届尤里卡世界发明博览会“军官勋章“证书(1988)
（14） 高等中医院校骨伤研究会客座教授聘书（1989）
（15） 中华全国中医学会外科学会小针刀疗法主任委员证书（1991）
（16） 泰中医药促进会名誉顾问邀请书（1991）
（17） 美洲中医药针灸协会学术顾问
（18） 美国中医跌打伤科协会名誉顾问
（19） 加州执照针灸医师协会学术顾问
（20） 美国科学院创伤应激专家协会聘为会员(2000)
（21） 2001年1月8日被聘为协和医科大学客座教授(2001)
（22） 2001年元月联合国教科文组织行星命名局以朱汉章命名小犬座新发现的一颗小行星，朱氏成为首位被该组织以星座命名的中国医务工作者（2001）